初期設定

Rの初期設定

Rを起動すると、プロファイル(.Rprofile)と環境変数(.Renviron)が読み込まれる。それぞれの役割は次の通り。

.Rprofile

R起動時のバッチファイルと考えれば良い。例えば、起動するたびにパッケージの更新を確認するような手間を省くために、このファイルの中に、update.packages()を書いておくとよい。

• options() message()の設定
• CRANのミラーサイトresposの設定

.Renviron

Rの環境設定変数が保存される。具体的には

• Rのパッケージライブラリの保存ディレクトリ
• プログラムに直接記入してはならないAPIキーの保存

初期設定ファイルの保存場所

初期設定ファイルは起動時に一度だけ読み込まれるが、同一名のファイルが複数のディレクトリに保存されている場合、優先順位がある。

R_HOME

Rのシステムがインストールされているディレクトリ（R.home()で表示される。）のサブフォルダetc

HOME

ユーザのホームディレクトリ(Linux: /home/username Windows: c:\Users\username

作業ディレクトリ

getwd()で得られるディレクトリ

下ほど優先順位が高い。すなわち、作業ディレクトリに初期設定ファイルがあればそれを優先し、他は無視する。

ファイルの作成方法

プロジェクト固有の起動スクリプトを用意したい場合

file.edit('.Rprofile')
※ホームディレクトリの.Rprofileは割愛される

固有ディレクトリかHOMEディレクトリかの違い

file.edit(file.path("~", ".Rprofile")) # HOMEディレクトリの .Rprofile を編集する
file.edit(".Rprofile") # プロジェクト固有の .Rprofile を編集する

.Renvironも同様の振る舞いをする

APIキーなどをプロジェクトをまたがって利用したい場合、以下のようにする。

user_renviron = path.expand(file.path("~", ".Renviron"))
if(!file.exists(user_renviron)) # 既存のファイルがあるかチェック
  file.create(user_renviron)
file.edit(user_renviron) # テキストエディタで開くことも可能

参考

• https://csgillespie.github.io/efficientR/r-startup.html